完成一天的擠奶工作后，首要任務是清洗移動擠奶車上的擠奶機。擠奶機的清洗有一定的規定。通常情況下，清洗分為三步進行。第一步是使用接近鮮奶溫度的清水清洗擠奶機。第二步是使用80度左右的高溫清水加酸堿混合液對擠奶機進行全面清洗。較后一步是用溫水或冷水進行清洗。 　　首先，打開水閥，較好將閥門手柄打到45度的位置。接著關閉氣閥，水閥在下面，氣閥在上面。還有一個重要的問題是，確保水槽里有足夠的水，并將水槽上方的方蓋推到三分之二的位置，這樣可以保證水槽中有足夠的空氣進入，防止水槽被吸扁。 　　其次，打開所有閥門，包括吸奶器座子下面的水管和通往奶瓶的透明管子。還要按下吸奶器吸頭上的提閥。
　　第三，準備工作完成后，啟動電機，當電壓表讀數約為400時開始供電。打開控制箱閘閥，開啟真空泵。此時要注意，表盤上有一個奶泵按鈕，可以在整個清洗過程結束后按下此按鈕，將奶罐中的余水泵出管道外。如果啟動奶泵按鈕后仍有水分未排凈，需要手動完成較后的排水工作。 　　第四，檢查真空表上的讀數是否為0.048，這個表通常位于真空泵的上方接近車頂的位置。還要檢查真空泵上面的滲油盒是否正常滲油，如果沒有正常滲油，需要清理疏通小管道以確保正常滲油。因為真空泵內不能斷油，否則會導致刮片與泵殼摩擦產生高熱，嚴重情況下還可能導致泵體破裂事故。
　　第五，此時水液已經在管道和奶瓶中快速沖洗，需要隨時關注洗奶機運轉過程中的細節。 　　較后，當吸奶器和儲奶瓶按照以上規定清洗幾遍后，清洗結束時要關閉設備。關閉設備的步驟與開啟設備相反，先關閉真空泵，然后點一下奶泵按鈕。因為部分水仍然儲存在奶泵中，點一下奶泵可以迅速將水排出機外。如果仍有一部分水未排凈，可以手動打開管頭閥門，釋放余水。這樣就算是比較全面的清洗了。